Rakitnica je jedno od najznačajnijih povijesnih lokaliteta vodičkog zaleđa, a u pisanim izvorima prvi se put spominje još 1311. godine.
I danas su vidljivi ostaci nekadašnjih kuća i suhozidnih zidina koji svjedoče o životu na ovom prostoru tijekom srednjeg vijeka.
U neposrednoj blizini nalazi se crkva sv. Ivana Krstitelja, sagrađena 1445. godine kada je osnovana i župa Rakitnica. Crkva i danas predstavlja važan simbol nekadašnjeg naselja i njegove duhovne baštine.
Zbog sve češćih osmanskih prodora početkom 16. stoljeća, šibenski plemići i lokalno stanovništvo započeli su 1509. godine gradnju utvrde Gradina na strmom grebenu iznad naselja. Tijekom 17. stoljeća na ovom području vodile su se brojne borbe između mletačke i osmanske vojske, a konačni mir nastupio je tek 1699. godine nakon povlačenja Osmanlija iz ovoga kraja.
Danas Rakitnica predstavlja vrijedan spoj arheološke, povijesne i kulturne baštine. Posjetiteljima pruža uvid u srednjovjekovni život vodičkog zaleđa, obrambeni sustav protiv Osmanlija te razvoj naselja koja su obilježila povijest ovoga dijela Dalmacije.